Le LABERCA est Laboratoire National de Référence auprès du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation pour de nombreuses classes de substances :
A ce titre, il a pour pour missions de :
Le LABERCA fait également partie des réseaux européens des laboratoires de référence, animé par le National Food Institute à Copenhague pour les HAP, le Wageningen Food Safety Research (WFSR) à Wageningen pour les promoteurs de croissance, le Federal Office of Consumer Protection and Food Safety (BVL) à Berlin pour les béta-agonistes et le CVUA à Freiburg pour les dioxines, les PCBdl et les PCBndl.
Le LABERCA a également un rôle de référent auprès de la DGAl pour différentes familles de contaminants chimiques dont la mélamine et la cystéine dans les aliments destinés à l’Homme, les substances considérées comme émergentes qui regroupent les nouveaux retardateurs de flamme bromés, les retardateurs de flamme organophosphorés, les chloroparaffines ou encore les composés perfluoroalkylés.