Présentation


Qui sommes-nous ?

 

Oniris, via sa plateforme MELISA (MEtabolomics LIpidomics Steroidomics Analysis), met à disposition son savoir-faire et ses instruments au service de la communauté des chercheurs et des industriels nationale. Ses équipements variés et performants de spectrométrie de masse (basse ou haute résolution, multidimensionnelle ou isotopique) couplés à toute forme de chromatographies (phases gazeuse, liquide ou supercritique) répondent aux nombreuses sollicitations de la communauté. La plateforme MELISA intègre des activités liées à l’analyse structurale, au dosage et à l’analyse métabolomique. De plus, de par son historique, le Laberca possède une expertise dans le domaine de la stéroïdomique.

 

 

La plateforme est membre de la composante "Analyses structurale et métabolomique" (Corsaire) du réseau Biogenouest.

www.pf-corsaire.org

www.biogenouest.org

Le développement de la plateforme MELISA du LABERCA est en partie cofinancé par l'Union européenne. L’Europe s'engage en Pays de la Loire avec le Fonds européen de développement régional.

www.europe.paysdelaloire.fr

Offre de services

Nous mettons l'expertise et les forces technologiques de la plateforme au service de projets académiques et privés.

Les prestations proposées :

La plateforme fournit des installations et de l'expertise pour :

  • La conception, la réalisation, l’interprétation de données et la valorisation des résultats (collaboration ou service) 
  • Le traitement avancé des données et analyse de données grâce à des outils bio-informatiques et statistiques dédiés 
  • La réalisation de dosages à façon
  • La formation individuelle et collective en analyse spectrométrique, à la fois théorique et pratique 
  • L’organisation de journées thématiques et d'ateliers pratiques 
  • L'accueil de stagiaires

 

Les développements :

Outre ses activités de prestations de service, la plateforme poursuit ses développements méthodologiques autour des innovations technologiques, de l'évaluation et la mise en œuvre de nouvelles technologies mais également autour de l'étape de traitement des données.

Nos prestations

Assurance Qualité

La conception, la conduite et la réalisation de projets d’analyses métabolomiques sont menées en conformité avec la norme ISO 9001 : 2015. La certification est délivrée par INTERTEK. En 2018, la PF-MELISA a été labélisée IBISA (GIS Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie).

 

Instrumentation

 

La plateforme MELISA ouvre l’accès à l’ensemble de son parc analytique pour répondre à des demandes extérieures aussi variées que le dosage de traces, le profilage métabolique ou encore l’élucidation structurale de biomarqueurs d’exposition ou d’effet. Ces investigations sont basées sur l’étude de spectres de masse MS/MS et la compréhension des fragmentations, la lecture et l’interprétation des masses exactes, les rapports isotopiques grâce aux informations fournies par les technologies MS, HRMS, MS/MS, MSn, IRMS et EA.

 

 

Communication/Publications

La PF-MELISA est fortement impliquée dans les enseignements de plusieurs Masters des universités de Nantes et de Rennes et participe régulièrement à des activités de formation initiale ou professionnelle.

La plateforme est identifiée dans le cadre du Réseau francophone de métabolomique et de fluxomique (RFMF) et est particulièrement impliquée dans la dynamisation de la communauté métabolomique française à travers cette société savante et les dernières innovations comme les écoles chercheurs internationales  (https://workflow4metabolomics.org/events).

 

 

 

Publications clé de la plateforme

  • Narduzzi L, Royer AL, Bichon E, Guitton Y, Buisson C, Le Bizec B, Dervilly-Pinel G. Ammonium Fluoride as Suitable Additive for HILIC-Based LC-HRMS Metabolomics. 2019. https://doi.org/10.3390/metabo9120292
  • Léon A, Cariou R, Hutinet S, Hurel J, Guitton Y, Tixier C, Munschy C, Antignac JP, Dervilly-Pinel G, Le Bizec B. HaloSeeker 1.0: A User-Friendly Software to Highlight Halogenated Chemicals in Nontargeted High-Resolution Mass Spectrometry Data Sets. https://doi.org/10.1021/acs.analchem.8b05103
  • Cano-Sancho G, Alexandre-Gouabau MC, Moyon T, Royer AL, Guitton Y, Billard H, Darmaun D, Rozé JC, Boquien CY, Le Bizec B, Antignac JP. Simultaneous exploration of nutrients and pollutants in human milk and their impact on preterm infant growth: An integrative cross-platform approach. 2019. https://doi.org/10.1016/j.envres.2019.109018
  • Borgsmüller N, Gloaguen Y, Opialla T, Blanc E, Sicard E, Royer AL, Le Bizec B, Durand S, Migné C, Pétéra M, Pujos-Guillot E, Giacomoni F, Guitton Y, Beule D5, Kirwan J. WiPP: Workflow for Improved Peak Picking for Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) Data. 2019. https://doi.org/10.3390/metabo9090171
  • Auger B, Pouvreau JB, Pouponneau K, Yoneyama K, Montiel G, Le Bizec B, Yoneyama K, Delavault P, Delourme R, Simier P. Germination stimulants of Phelipanche ramosa in the rhizosphere of Brassica napus are derived from the glucosinolate pathway. 2012. https://doi.org/10.1094/MPMI-01-12-0006-R 
  • Alexandre-Gouabau, M.-C.; Moyon, T.; Cariou, V.; Antignac, J.-P.; Qannari, E. M.; Croyal, M.; Molamine, M.; Guitton, Y.; David-Sochard, A.; Billard, H.; et al. Breast Milk Lipidome Is Associated with Early Growth Trajectory in Preterm Infants. 2017. https://doi.org/10.20944/preprints201712.0068.v1.
  • Cesbron, N.; Royer, A.-L.; Guitton, Y.; Sydor, A.; Bizec, B. L.; Dervilly-Pinel, G. Optimization of Fecal Sample Preparation for Untargeted LC-HRMS Based Metabolomics. Metabolomics 2017, 13 (8), 99. https://doi.org/10.1007/s11306-017-1233-8
  •  Guitton, Y.; Tremblay-Franco, M.; Le Corguillé, G.; Martin, J.-F.; Pétéra, M.; Roger-Mele, P.; Delabrière, A.; Goulitquer, S.; Monsoor, M.; Duperier, C.; et al. Create, Run, Share, Publish, and Reference Your LC–MS, FIA–MS, GC–MS, and NMR Data Analysis Workflows with Workflow4Metabolomics 3.0, the Galaxy Online Infrastructure for Metabolomics. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology 2017. https://doi.org/10.1016/j.biocel.2017.07.002
  • Marchand, J.; Martineau, E.; Guitton, Y.; Dervilly-Pinel, G.; Giraudeau, P. Multidimensional NMR Approaches towards Highly Resolved, Sensitive and High-Throughput Quantitative Metabolomics. Current Opinion in Biotechnology 2017, 43, 49–55. https://doi.org/10.1016/j.copbio.2016.08.004
  • Peng, T.; Royer, A.-L.; Guitton, Y.; Bizec, B. L.; Dervilly-Pinel, G. Serum-Based Metabolomics Characterization of Pigs Treated with Ractopamine. Metabolomics 2017, 13 (6), 77. https://doi.org/10.1007/s11306-017-1212-0

 

 

Membres de l'équipe/Contact

Référent                                                            

Yann GUITTON
Responsable de la plateforme MELISA

Contact

Membres de l'équipe

Anne-Lise Royer (Adjointe)

Justine Massias

Marie-Line Morvan

Lauriane Rambaud

Axel Raux